【经文】“曼殊室利，是为彼世尊药师琉璃光如来、应、正等觉行菩萨道时，所发十二微妙上愿。
【直译】“文殊师利，这就是世尊药师琉璃光如来修行菩萨道时，所发微妙不可思议的十二大愿。
【解说】药师佛所行菩萨道时所发十二大愿，前五愿是依道灭二谛所发，着重于佛道的修证；后七愿是依苦集二谛所发，着重于世间疾苦的消除与福乐的增益。这十二大愿，不仅解救人间现实的灾厄与苦难，令人福寿康宁，所求如意；同时令人离诸魔障，趣向佛道，成等正觉，究竟离苦得乐。
【经文】“复次，曼殊室利，彼世尊药师琉璃光如来行菩萨道时，所发大愿，及彼佛土功德庄严，我若一劫［１］、若一劫余，说不能尽。然彼佛土，一向清净，无有女人，亦无恶趣，及苦音声。琉璃为地，金绳界道，城阙［２］、宫阁、轩窗、罗网，皆七宝成；亦如西方极乐世界，功德庄严，等无差别。于其国中，有二菩萨摩诃萨：一名日光遍照、二名月光遍照，是彼无量无数菩萨众之上首，次补佛处，悉能持彼世尊药师琉璃光如来正法宝藏。是故曼殊室利，诸有信心善男子、善女人，应当愿生彼佛世界。”
【注释】１、劫：时间单位，泛指极长的时间。２、阙：古代宫殿、祠庙、城门或陵墓前的高台，通常左右各一，台上起楼观。二阙之间有道路。
【直译】“再者，文殊师利，世尊药师琉璃光如来修行菩萨道时所发大愿，以及琉璃世界以功德成就的美妙依身，即使我用一大劫，或者更多的世间，来详尽地讲说，也没有办法讲完。药师琉璃光如来的佛土，一向清净无比，其中没有女人身形（永离一切淫欲恶念），也没有地狱、恶鬼、畜生等恶道，甚至连痛苦的声音也没有。东方琉璃世界琉璃为地，道路用金绳界定，城楼、宫殿、长廊、门窗、罗网等，皆是金、银、琉璃、水晶、砗磲、珍珠、玛瑙等七宝而成，就如西方极乐世界一样，美妙无比，毫无差别。药师琉璃世界中有两位菩萨，一位名叫日光遍照菩萨、一位名叫月光遍照菩萨，是琉璃世界无量无数菩萨中为首的两位大菩萨，药师琉璃光如来灭度后，将依次递补佛位；他们皆能修持和传承世尊药师琉璃光如来正法宝藏。因此，文殊师利，所有坚信药师琉璃光如来的善男子、善女人，都应当发愿，求生东方琉璃世界。”
【解说】净琉璃世界依正庄严。
国土清净。佛国净土的众生，皆是莲花化生，没有男女之相，唯有丈夫相，亦没有男女之间的烦恼。经云：无有女人，是从女性的角度说没有女事和淫心，但仍然有女饰，表示庄严，比如观世音菩萨，便是以女饰出现。
眷属庄严。二位大菩萨，日光遍照和月光遍照。是东方净琉璃世界无量无数菩萨众之上首，次第补佛处。过去世电光如来时，有一梵士医王，养育日照、月照二子，发心愿利乐众生，二子亦发愿供养。梵士医王即今之药师如来，二子即日光、月光二菩萨。日光遍照菩萨的名号，是取自“日放千光，遍照天下，普破冥暗”的意思。日光能破黑暗，表示菩萨的智慧光明，能照破众生无明烦恼长夜的黑暗；月光清凉，表示菩萨的慈悲，能令众生除热恼，得清凉。农历八月十五。是中国传统的中秋节，在汉传佛教中，农历八月十五日中秋节这一天，恭逢月光菩萨圣诞。
劝信愿生。释尊既已介绍药师如来，因中的行愿功德，及果上依正庄严，所以劝诸有情，发愿求生彼国。凡对药师如来有信心的七众佛弟子，都应当发愿，求生彼药师佛的净琉璃世界，一则可以避免众苦，二则可以常随佛学，饱餐法味，受众妙乐。
此段经文描述的是琉璃世界净土的情况。是民生安乐，物资富足的世界；是社会净化，没有烦恼恶业的世界；是没有病苦，身心康乐的世界。
人寿由最初的八万四千岁起，每过一百年减一岁，减至十岁止，再由十岁起每过一百年增一岁，增至原来的八万四千岁，这样一减一增，为一小劫。合二十个小劫为一中劫。历成、住、坏、空四个中劫，为一大劫，一大劫为一世界由成至毁的年数。坏劫初十九小劫坏有情，后一小劫坏器界；坏劫之后有二十小劫呈虚空状态（空劫）；其后产生微细风，经一小劫成器界，次十九小劫形成有情（成劫）；又有二十小劫称为住劫，初一住小劫从人寿八万四千岁渐减至十岁，称为减劫；此后中间十八小劫皆各有一增一减，即从十岁每百年增一岁，至八万四千（此称增劫），再从八万四千减至十年，最后一小劫唯有增劫。
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